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探索自然每一种
珍稀菌物 大型真菌标本 · 分子系统发育 · 一体化管理软件

从 AB1 色谱到物种鉴定只需一键。菌树 FungTree 集标本采集、序列分析、BLAST 鉴定、系统发育重建与团队协作于一体——自研引擎加国际标准,让科研全链路在一台电脑上闭环。

2种模式
可选择单机、网络模式
4
国际标准引擎
3
自研科学引擎
全链路
采集到发表闭环
Core Pillars

为什么选择 菌树

三大自研引擎叠加国际金标工具,把传统数小时的真菌分子鉴定流程,压缩到一杯咖啡的时间。

01 / 建树

永远给你一棵树

独创三级 fallback 建树链:金标 IQ-TREE2 优先,失败自动切换自研 PhyloFungi 最大似然,再降级邻接法 NJ。无论数据如何,始终产出一棵可解读的系统发育树。

IQ-TREE2PhyloFungi MLNJBootstrap
02 / 鉴定

BLAST 双引擎检索

本地 BLAST+ 数据库支持离线检索,未命中时可转 NCBI 在线比对;结果返回相似度、覆盖度与物种分类信息,供研究者综合判断,不替代人工复核。

BLAST+ 本地NCBI 在线Taxonomy
03 / 比对

ITS 感知多序列比对

自研 fungaligner 引擎针对真菌 ITS 区优化,比通用比对工具更懂真菌的序列特征;搭配 smarttrim 智能修剪,自动识别低质量区域、去引物、去噪音。

fungalignersmarttrimITS 提取
04 / 管线

一键全自动分析

导入 AB1 文件,一条管线自动完成:质量评估 → 引物检测 → 重峰识别 → 智能修剪 → BLAST 鉴定。传统需要多软件、数小时的工作,15S/条到无限批量

AB1 读取峰检测去卷积质控
Workflow

覆盖菌物研究完整工作流

从野外采集到分子鉴定,从数据管理到论文发表——一朵蘑菇的科研生命周期,一个软件全搞定。

野外采集

手机拍照自动提取 EXIF、GPS 与海拔,支持离线录入,回到网络环境一键同步至桌面端。

AB1 色谱分析

读取 Sanger 测序 AB1 文件,峰检测、去卷积、混合峰识别、共识序列拼接与质量评估。

BLAST 鉴定

本地 + NCBI 双引擎检索,物种 taxonomy 自动归属,提供相似度与覆盖度等参考指标。

系统发育建树

三级 fallback 始终产出结果,支持 Bootstrap 自展检验,生成可发表级系统发育树图。

调查报告

根据您的标本数据自动分析数据、为您提供一份标准格式的大型真菌调查报告。

Windows Desktop · v2.0.0

桌面端完整分析套件

Python + FastAPI + React 单机架构,本地 58000 端口运行,数据不出本机。内置四大国际标准工具链与三大自研引擎,离线可用。

  • 标本档案管理
    卡片式标本库、图片/EXIF/GPS 关联、多维度筛选与批量操作
  • AB1 色谱图交互浏览
    峰图缩放、引物标注、重峰高亮、质量曲线一图统览
  • 多序列比对与建树可视化
    MAFFT / 自研比对,phylocanvas 交互式系统发育树渲染
  • 地理热力图与多样性统计
    leaflet 地图热力、采集时间线、物种多样性多维分析
BLAST+ MAFFT IQ-TREE2 MrBayes PhyloFungi fungaligner smarttrim
Download

下载测试版

当前为内部测试版本,可供体验与反馈。安装前请阅读下方安装说明。

菇小二网络版图标

菇小二 · Android 网络版

菇小二网络版 App · v1.8.4
版本 1.8.4 14.6 MB Android 6.0+ ARM64 / ARMv7

适合野外采集、标本录入与团队协作。此包为联网版,使用账号与服务器同步数据,已使用正式发布证书签名。

Windows 桌面版

FungTree · 单文件预览版 · 2026-10-10
单文件预览版 EXE 198.0 MB Windows 10/11 x64 无需解压

最新单文件预览版:优化峰图显示,右上角增加检查更新和帮助入口,用户名称以文字显示。修复切换页面后更新窗口未收起的问题,检查和下载期间可以关闭窗口。尚未完成 Windows 代码签名;已连接官网下载更新源,可检查并下载经过签名校验的新版本。

原目录安装版(R8):保留完整包和更新包。已有安装升级前请备份数据,保留 data、tools 和外置目录设置。

菌树 FungTree 图标

菌树 · Android 单机版

菌树 FungTree 单机版 App · v1.3.2
版本 1.3.210.0 MBAndroid 6.0+发行证书签名

用于本地标本采集、管理与桌面传输,数据保存在设备中。支持联网自动补全采集地址。此包使用 Release 构建及发行证书签名,与联网版分开安装。

旧 Debug 测试包用户:签名不同,无法直接覆盖安装。请先保留旧应用,将本地采集资料传输至桌面端并核对完整,再安排迁移。

Installation

安装说明

按顺序操作即可。如遇问题,可在测试反馈群联系。

Android 安装

  1. 根据用途选择菇小二网络版 APK或菌树单机版 APK,保存到手机或电脑。
  2. 在手机「设置 → 安全」中开启允许安装未知来源应用。
  3. 找到下载的 APK 文件,点击安装。
  4. 菇小二网络版登录账号使用;菌树单机版进入本地工作台,进行标本采集与管理。
  5. 联网版同步与团队功能需要网络;单机版数据保存在设备中,卸载前请先备份或传输。测试签名与其他签名不一致时,请勿直接卸载旧版。

Windows 安装

  1. 单文件预览版:下载后保留文件名「菌树FungTree.exe」,保存到固定目录并双击启动,无需解压。
  2. 目录安装版:下载 R8 完整包,将压缩包保存到本地;后续解压步骤适用于此版。
  3. 首次安装请解压完整包到可写目录,并保留配套工具文件。
  4. 已有安装先退出软件,将程序更新包中的 EXE 放入原程序目录;保留原有 data、tools 和已保存的目录设置。
  5. 双击运行 菌树FungTree.exe。首次安装会创建本地数据库;已有录入数据不会随更新包分发。
  6. 首次使用请联网启用7 天试用,到期后需激活。重新安装不会重置同一机器的试用截止时间。